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-| 2     | 10.01  | Bivariate techniques (Box-Muller algorithm), ratio-of-uniforms method ​                                | [[http://​www.math.ntnu.no/​emner/​TMA4300/​2019v/​Lecture2/​Lecture2.pdf| Slides]] ​  ​| [[http://​www.math.ntnu.no/​emner/​TMA4300/​2019v/​Lecture3/​inversion.R|R code to illustrate inversion sampling]] ​                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       | GL: 1.3.2, GH: 6-6.2.2 ​                       +| 2     | 10.01  | Bivariate techniques (Box-Muller algorithm), ratio-of-uniforms method ​                                | [[http://​www.math.ntnu.no/​emner/​TMA4300/​2019v/​Lecture2/​Lecture2.pdf| Slides]] ​   | [[http://​www.math.ntnu.no/​emner/​TMA4300/​2019v/​Lecture3/​inversion.R|R code to illustrate inversion sampling]] ​                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ​| GL: 1.3.2, GH: 6-6.2.2 ​                           
-| 2     | 11.01  | Methods based on mixtures, multivariate Normal, Rejection sampling ​                                   | [[http://​www.math.ntnu.no/​emner/​TMA4300/​2019v/​Lecture3/​Lecture3.pdf| Slides]] ​  ​| [[http://​www.math.ntnu.no/​emner/​TMA4300/​2019v/​Lecture3/​ratio_of_unif.R|R code to illustrate ratio of uniforms method and mixtures method]],​[[http://​www.math.ntnu.no/​emner/​TMA4300/​2019v/​Lecture3/​rejection_sampling.R|R code to illustrate rejection sampling]] ​                                                                                                                                                                                                                   | GL: 1. 4, 1.5.1, GH:6.2.2, 6.2.3              +| 2     | 11.01  | Methods based on mixtures, multivariate Normal, Rejection sampling ​                                   | [[http://​www.math.ntnu.no/​emner/​TMA4300/​2019v/​Lecture3/​Lecture3.pdf| Slides]] ​   | [[http://​www.math.ntnu.no/​emner/​TMA4300/​2019v/​Lecture3/​ratio_of_unif.R|R code to illustrate ratio of uniforms method and mixtures method]],​[[http://​www.math.ntnu.no/​emner/​TMA4300/​2019v/​Lecture3/​rejection_sampling.R|R code to illustrate rejection sampling]] ​                                                                                                                                                                                                                  ​| GL: 1. 4, 1.5.1, GH:6.2.2, 6.2.3                  
-| 3     | 15.01  | Finish rejection sampling, adaptive rejection sampling, Monte Carlo integration,​ importance sampling ​ | [[http://​www.math.ntnu.no/​emner/​TMA4300/​2019v/​Lecture4/​Lecture4.pdf| Slides]] ​  ​                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ​| GL: 1.5 (all), GH: 6.2.3 (all), 6.3.1, 6.4.1  +| 3     | 15.01  | Finish rejection sampling, adaptive rejection sampling, Monte Carlo integration,​ importance sampling ​ | [[http://​www.math.ntnu.no/​emner/​TMA4300/​2019v/​Lecture4/​Lecture4.pdf| Slides]] ​                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      | GL: 1.5 (all), GH: 6.2.3 (all), 6.3.1, 6.4.1      
-| 3     | 17.01  | Finished inportance sampling, Intro to bayesian statistics ​                                           | [[http://​www.math.ntnu.no/​emner/​TMA4300/​2019v/​Lecture5/​Lecture5.pdf| Slides]] ​  ​|  [[http://​www.math.ntnu.no/​emner/​TMA4300/​2019v/​Lecture5/​Importance_sampling.R|R code to illustrate importance sampling]] ​                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           | GL: 2.1, 2.2,                                 ​+| 3     | 17.01  | Finished inportance sampling, Intro to bayesian statistics ​                                           | [[http://​www.math.ntnu.no/​emner/​TMA4300/​2019v/​Lecture5/​Lecture5.pdf| Slides]] ​   |  [[http://​www.math.ntnu.no/​emner/​TMA4300/​2019v/​Lecture5/​Importance_sampling.R|R code to illustrate importance sampling]] ​                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ​| GL: 2.1, 2.2,                                     ​
-| 6     | 05.02  | More on Bayesian statistics, MCMC intro                                                               | [[http://​www.math.ntnu.no/​emner/​TMA4300/​2019v/​Lecture6/​Lecture6.pdf| Slides]] ​  ​| [[http://​www.math.ntnu.no/​emner/​TMA4300/​2019v/​Lecture6/​demo_toyMC2.R| R code to implement toy MCMC example]] ​                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       | GL: 2.3-2.4, 6.1-6.2, GH:​7.1 ​                 +| 6     | 05.02  | More on Bayesian statistics, MCMC intro                                                               | [[http://​www.math.ntnu.no/​emner/​TMA4300/​2019v/​Lecture6/​Lecture6.pdf| Slides]] ​   | [[http://​www.math.ntnu.no/​emner/​TMA4300/​2019v/​Lecture6/​demo_toyMC2.R| R code to implement toy MCMC example]] ​                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ​| GL: 2.3-2.4, 6.1-6.2, GH:​7.1 ​                     
-| 7     | 12.02  | Metropolis-Hasting algorithm and Gibbs sampling ​                                                      | [[http://​www.math.ntnu.no/​emner/​TMA4300/​2019v/​Lecture7/​Lecture7.pdf| Slides]] ​  ​                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ​| GL: 6.4, 5.1, 5.2, GH: 7.1-7.2 ​               +| 7     | 12.02  | Metropolis-Hasting algorithm and Gibbs sampling ​                                                      | [[http://​www.math.ntnu.no/​emner/​TMA4300/​2019v/​Lecture7/​Lecture7.pdf| Slides]] ​    ​[[http://​www.math.ntnu.no/​emner/​TMA4300/​2019v/​Lecture7/​demo_MCMC_RW.R| R code to illustrate RW proposal]], ​    ​[[http://​www.math.ntnu.no/​emner/​TMA4300/​2019v/​Lecture7/​demo_mcmcRao.R| R code for the Rao example]] ​                                                                                                                                                                                                                                                               ​| GL: 6.4, 5.1, 5.2, GH: 7.1-7.2 ​                   
-| 7     | 14.02  |                                                                                                       ​| [[http://​www.math.ntnu.no/​emner/​TMA4300/​2019v/​Lecture8/​Lecture8.pdf| Slides]] ​  ​                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ​                                              ​|+| 7     | 14.02  | Gibbs sampling, Convergence diagnostic ​                                                               ​| [[http://​www.math.ntnu.no/​emner/​TMA4300/​2019v/​Lecture8/​Lecture8.pdf| Slides]] ​   ​| ​ [[http://​www.math.ntnu.no/​emner/​TMA4300/​2019v/​Lecture8/​demo_linear_reg_Gibbs.R| R code to implement Gibbs sampling for linear regression]], ​    ​[[http://​www.math.ntnu.no/​emner/​TMA4300/​2019v/​Lecture8/​Vikings.R| R code to implement Gibbs sampling for the vikings example]] ​                                                                                                                                                                                                   | GL: 6.4, 5.3, 5.4, GH: 7.2-7.3 ​                   | 
 +| 7     | 15.02  | Convergence diagnostic, Intro to INLA                                                                 | [[http://​www.math.ntnu.no/​emner/​TMA4300/​2019v/​Lecture9/​Lecture9.pdf| Slides]] ​   |                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    | GL:5.3,5.3, GH:​7.2,​7.3 ​                           | 
 +| 8     | 19.02  | Integrated nested Laplace approximation (INLA) ​                                                       | [[http://​www.math.ntnu.no/​emner/​TMA4300/​2019v/​Lecture10/​Lecture10.pdf| Slides]] ​ | [[http://​www.math.ntnu.no/​emner/​TMA4300/​2019v/​Lecture10/​Taylor_expansion.R| R code to illustrate the GMRF approximation]] ​ , [[https://​www.precision-analytics.ca/​blog-1/​inla| A gentle introduction to INLA]] ​                                                                                                                                                                                                                                                                    ​| ​                                                  | 
 +| 8     | 21.02  | Integrated nested Laplace approximation (INLA) ​                                                       | [[http://​www.math.ntnu.no/​emner/​TMA4300/​2019v/​Lecture11/​R_INLA.pdf| Slides]] ​    | [[http://​www.math.ntnu.no/​emner/​TMA4300/​2019v/​Lecture11/​inla_simple.R|Simple example of R-INLA]] ​ , [[http://​www.math.ntnu.no/​emner/​TMA4300/​2019v/​Lecture11/​Scotland.R|Besag model with INLA]] ​ ,    [[http://​www.math.ntnu.no/​emner/​TMA4300/​2019v/​Lecture11/​R_INLA|R code from the slides]] ​                                                                                                                                                                                      ​| ​                                                  | 
 +| 11    | 12.03  | Bootstrap ​                                                                                            | [[http://​www.math.ntnu.no/​emner/​TMA4300/​2019v/​Lecture12/​Lecture12.pdf| Slides]] ​ | [[http://​www.math.ntnu.no/​emner/​TMA4300/​2019v/​Lecture12/​Bootstrap_intro.R|R code with intro to bootstrap]] ​                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        | GH: 9.1, 9.2                                      | 
 +| 11    | 15.03  | Bootstrap ​                                                                                            | [[http://​www.math.ntnu.no/​emner/​TMA4300/​2019v/​Lecture13/​Lecture13.pdf| Slides]] ​ | [[http://​www.math.ntnu.no/​emner/​TMA4300/​2019v/​Lecture13/​boot_example.R|R code with  bootstrap example]], ​   [[http://​www.math.ntnu.no/​emner/​TMA4300/​2019v/​Lecture13/​demo-pairedBootstrap.R|R code Nickel Alloy example]], ​ [[http://​www.math.ntnu.no/​emner/​TMA4300/​2019v/​Lecture13/​lutenizing_boot.R|R code Lutenizing hormon example]] ​                                                                                                                                           | GH: 9.3.1, 9.5.1, 9.5.2 (until 9.5.2.3 included) ​ | 
 +| 12    | 19.03  | Bootstrap and permutation test                                                                        | same slide as last time                                                          |                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    |                                                   | 
 +| 12    | 22.03  | EM algorithm ​                                                                                         | [[http://​www.math.ntnu.no/​emner/​TMA4300/​2019v/​Lecture15/​Lecture15.pdf| Slides]] ​ |                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    | GH: 4.1, 4.2                                      | 
 +|       | 11.04  | Summary ​                                                                                              | [[http://​www.math.ntnu.no/​emner/​TMA4300/​2019v/​summary.pdf| Slides]] ​             ​                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ​|
2019-02-13, Sara Martino